Son ascendance n’est pas claire, il est soit le fils de Chabataka et de la reine Kalhat (ou Qalhata), soit comme le proposent Aidan Mark Dodson, Dyan Hilton et Robert George Morkot, celui de Chabaka et de la reine Tabekenamon.

Il épouse Pijearti, Malakaie, Isetemkheb et Asalka. Son neveu Atlanersa succèdera à Tanoutamon mais uniquement dans sa capitale de Napata de -653 à -643 (ou -640). Ses descendants sont à l’origine des pharaons de Napata et de la civilisation méroïtique.

Il reprend la lutte pour concrétiser le rêve de son père et s’engage immédiatement dans une campagne militaire contre les souverains rebelles du Nord, dont le roi de Saïs Nékao Ier mis en place par les Assyriens. Il assiège et prend Memphis et Nékao Ier meurt au cours de la bataille.

La victoire est de courte durée, sa reconquête de Memphis impose aux Assyriens de prendre des sanctions. L’empereur Assurbanipal lance un corps d’armée contre l’Égypte et la cité retombe aux mains des Assyriens. Tanoutamon se réfugie à Thèbes. Les Assyriens le poursuivent, la bataille est terrible, la ville est entièrement ravagée et tous les trésors accumulés dans les temples sont pillés. À Saïs, Psammétique Ier, le successeur de Nékao Ier, profite de cette déroute de Tanoutamon pour prendre en -656 le contrôle de la région. Les rois nubiens ne remonteront plus jamais en Égypte, c’est le glas des « Pharaons noirs ».

Néanmoins, Tanoutamon continue à régner en Nubie. Il meurt en -656 et est enterré dans la nécropole royale d’El-Kourrou sous la pyramide Ku 16.